1993 nyarán közölte a Foreign Affairs című folyóirat Huntington A civilizációk összecsapása? című írását. Azóta sem szűnik a vita körülötte, a világ globalitását tanulmányozó tudósok, kutatók ellene és mellette egyaránt szót emelnek. Időközben Huntington könyvet írt koncepciójáról: a hidegháború utáni világ helyzetét igyekszik értelmezni, a világ összetartásának, széthúzásának és konfliktusainak szabályait elemzi, identitásait vizsgálja. Úgy látja, hogy a történelem során most először fordul elő, hogy a világpolitika sokpólusú és sokcivilizációjú, és ez nem vezet el az egyetemes civilizációhoz.